Как эксплуатант РК, осуществляющий коммерческую деятельность по нерегулярной воздушной перевозке пассажиров и багажа, ТОО «FlyJet.kz» имеет сертификат эксплуатанта №KZ-01/33 от 05 мая 2017 года, выданный уполномоченным органом в сфере гражданской авиации РК.
Компания зарегистрирована в реестре Евроконтроля и имеет право осуществлять коммерческие перевозки пассажиров и багажа на ВС, зарегистрированных в Республике Казахстан, согласно выданному сертификату TCO (EASA.TСO.KAZ-0010.01).
ТОО «FlyJet.kz», как эксплуатант РК, осуществляющий некоммерческую деятельность по нерегулярной воздушной перевозке пассажиров и багажа, и имеет свидетельство АОН-003-15 от 14 сентября 2015 года, выданное уполномоченным органом в сфере гражданской авиации РК.